Shopify Payments betalar ut i klumpar där avgifterna redan är avdragna. Det är det som gör att bokföringen av en Shopify-butik i Fortnox ofta slutar med en utbetalningsrapport och en person som pusslar vid månadsskiftet. Den här guiden visar hur flödet ser ut, vad som ska bokföras var, och hur det blir automatiskt.
Guiden handlar om bokföringen. Vill ni se hela integrationen – ordrar, lager, artiklar – finns den i Shopify Fortnox integration: så fungerar den.
Så ser en Shopify-utbetalning ut
En utbetalning från Shopify Payments innehåller flera ordrar, minus Shopifys avgift per transaktion, minus eventuella återbetalningar och justeringar. Beloppet som landar på banken är alltså nettot. Bokför ni bara det beloppet som försäljning blir intäkten för låg, momsen fel och avgiften osynlig.
| Post i utbetalningen | Vad det är | Bokförs som |
|---|---|---|
| Orderbelopp inkl. moms | Kundens betalning | Försäljning + utgående moms per order |
| Transaktionsavgift | Shopify Payments avgift | Kostnad på eget konto, t.ex. kortavgifter |
| Återbetalningar | Returer i perioden | Kreditfaktura som minskar försäljning och moms |
| Justeringar | Chargebacks, korrigeringar | Bokförs separat med underlag |
| Nettoutbetalning | Det som landar på banken | Betalning av kundfordran |
Två sätt att bokföra – ett som håller
Manuellt: utbetalningsrapporten
- Exportera Shopifys utbetalningsrapport per utbetalning.
- Bokför summan av försäljningen, momsen och avgifterna i ett verifikat.
- Fungerar vid låg volym och en marknad. Slutar fungera vid returer, flera länder eller B2B.
Automatiskt: order för order
- Varje Shopify-order blir kundfaktura i Fortnox med rätt konto och momssats.
- Utbetalningen från Shopify Payments matchas mot fakturorna, avgiften bokförs på sitt konto.
- Returer blir kreditfakturor automatiskt. Revisorn kan följa varje krona från order till bank.
Kontona som behöver bestämmas
- Försäljningskonto per momssats och marknad (Sverige 25 %, andra EU-länder via OSS, export utan moms).
- Fraktintäkter – egen rad eller del av försäljningen.
- Avgiftskonto för Shopify Payments (ofta kontokorts- eller bankavgifter – er redovisningskonsult väljer).
- Avräkningskonto för pengar på väg mellan Shopify och banken.
Det här är inte tekniska val, det är redovisningsval. Vi bygger mappningen efter vad er redovisningskonsult bestämmer.
Moms: där det oftast blir fel
Säljer ni bara i Sverige är momsen enkel. Säljer ni till konsumenter i andra EU-länder gäller OSS – momssatsen styrs av leveranslandet och rapporteras samlat. Säljer ni till företag inom EU med giltigt VAT-ID är försäljningen momsfri, men bara om VAT-ID:t följer med från Shopify till Fortnox. Standardapparna i Shopify App Store klarar oftast det första fallet men inte de två andra.
Klarna och andra betalsätt
Använder ni Klarna, Qliro eller Swish vid sidan av Shopify Payments kommer varje betalleverantör med sin egen utbetalning och sina egna avgifter. Principen är densamma: ett avräkningskonto per betalsätt, avstämning mot ordrarna, avgiften för sig.
Vanliga frågor
Hur bokför man en Shopify-utbetalning i Fortnox?
Dela upp utbetalningen i försäljning inklusive moms per order, Shopify Payments-avgift och eventuella återbetalningar. Nettot bokförs som betalning av kundfordran. Med en integration görs det automatiskt per order; manuellt görs det från Shopifys utbetalningsrapport.
Vilket konto ska Shopify Payments-avgiften på?
Ett kostnadskonto för kort- eller bankavgifter. Vilket exakt konto ni använder bestämmer er redovisningskonsult – integrationen mappar mot det konto ni väljer.
Hur hanteras moms vid försäljning till andra EU-länder?
Via OSS: momssatsen styrs av leveranslandet och rapporteras samlat till Skatteverket. Integrationen sätter momssats per order utifrån leveransadressen, så att OSS-underlaget blir rätt.
Kan bokföringen bli helt automatisk?
Ja. Med vår Synkr-koppling skapas kundfaktura, betalning, avgift och eventuell kreditfaktura automatiskt i Fortnox. Uppsättning från 5 000 kr och 450 kr per månad.
Vad händer när något inte stämmer?
Ordrar som inte kan bokföras hamnar i en felkö där ni ser orsaken – saknat artikelnummer, okänd momssats, ogiltigt VAT-ID – och kan köra om dem när felet är rättat.
Så jobbar vi
Vi är Shopify Plus Partner och BigCommerce Northern European Partner of the Year 2025, e-handelsbyrå i Göteborg sedan 2007. Vi bygger och driftar Shopify–Fortnox-kopplingen i vår egen integrationsplattform Synkr, och sätter upp mappningen tillsammans med er redovisningskonsult.
Läs vidare hos oss
- Shopify + Fortnox-integration (tjänst och pris)
- Shopify Fortnox integration: så fungerar den
- Shopify Payments i Sverige
Trött på utbetalningsrapporten?
Berätta hur ni bokför idag och vilka betalsätt ni har, så visar vi hur flödet ser ut automatiserat – och vad det kostar.





























